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  重大進(jìn)展：中國(guó)科學(xué)家揭示肺腺癌蛋白質(zhì)組完整圖譜
  
  2020-07-14 來源：轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)網(wǎng)
  
  盡管近年來，肺腺癌（LUAD）的基因組研究取得了顯著進(jìn)展，但仍有很大比例的LUAD患者仍缺乏針對(duì)性的治療策略。而由于蛋白質(zhì)是生命活動(dòng)的直接執(zhí)行者，因此對(duì)LUAD進(jìn)行全面的蛋白質(zhì)組學(xué)研究，可以填補(bǔ)基因組異常與致癌蛋白質(zhì)功能之間的知識(shí)空白。近日，中科院等國(guó)內(nèi)多家機(jī)構(gòu)的科學(xué)家在國(guó)際上揭示了肺腺癌蛋白質(zhì)組完整圖譜，為肺腺癌的精準(zhǔn)醫(yī)療提供了寶貴資源。
  
  這項(xiàng)研究通過蛋白質(zhì)組學(xué)，磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)，轉(zhuǎn)錄組和全外顯子組測(cè)序數(shù)據(jù)的綜合分析，揭示了LUAD相關(guān)分子特征、其與臨床結(jié)果的關(guān)聯(lián)、潛在的預(yù)后生物標(biāo)志物和藥物靶標(biāo)，并于7月9日在線發(fā)布在《Cell》上。題目為“Integrative Proteomic Characterization of Human Lung Adenocarcinoma”
  
  為了全面了解LUAD的分子結(jié)構(gòu)，并為L(zhǎng)UAD更精準(zhǔn)的診斷和治療提供基礎(chǔ)，科學(xué)家們?cè)诒狙芯恐袑?duì)103例LUAD患者的腫瘤組織及其對(duì)應(yīng)的非癌性鄰近組織進(jìn)行了蛋白質(zhì)組學(xué)和磷酸蛋白組學(xué)分析。共鑒定出11119個(gè)蛋白質(zhì)和22564個(gè)磷酸化位點(diǎn)。將這些蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)與臨床信息和基因組學(xué)數(shù)據(jù)相結(jié)合，得到了LUAD的一個(gè)全面的分子圖譜。
  
  圖形摘要
  
  科學(xué)家們發(fā)現(xiàn)，上皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)化以及炎癥和致癌信號(hào)通路，很可能導(dǎo)致I期LUAD的不良預(yù)后。他們進(jìn)一步建立了EGFR或TP53突變患者的基因改變和蛋白質(zhì)組學(xué)特征之間的聯(lián)系，EGFR或TP53是中國(guó)LUAD患者的兩個(gè)主要驅(qū)動(dòng)基因。
  
  在EGFR突變患者中，觀察到兩種組織學(xué)標(biāo)志物TTF-1和Napsin-A以及剪接體中蛋白質(zhì)的表達(dá)水平升高。在TP53突變患者中，包括DNA復(fù)制和錯(cuò)配修復(fù)在內(nèi)的多種致癌途徑發(fā)生了顯著變化。
  
  研究人員將所有患者分為三種蛋白質(zhì)組亞型（S-I，S-II，S-III），每種亞型均具有獨(dú)特的分子特征和臨床特征。全面的生物信息學(xué)分析顯示，S-I患者與細(xì)胞環(huán)境和良好的預(yù)后相關(guān)。相比之下，S-III患者與細(xì)胞增殖和蛋白質(zhì)組穩(wěn)定性以及預(yù)后不良有關(guān)。磷酸蛋白質(zhì)組學(xué)分析進(jìn)一步揭示了不同蛋白質(zhì)組學(xué)亞型中激活的信號(hào)通路和激酶。蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)和臨床數(shù)據(jù)的綜合分析進(jìn)一步揭示了27種潛在的血漿生物標(biāo)志物和LUAD的多個(gè)藥物靶標(biāo)。其中，研究人員指出，HSP 90β是潛在的生物標(biāo)志物之一，并已在一個(gè)獨(dú)立隊(duì)列中得到進(jìn)一步驗(yàn)證。
  
  這項(xiàng)工作為L(zhǎng)UAD的研究提供了新見解，超越了當(dāng)前的基因組研究。中國(guó)科學(xué)家在國(guó)際上對(duì)肺腺癌開展了大規(guī)模、高通量、系統(tǒng)性的全景蛋白質(zhì)組學(xué)研究，在基因組學(xué)，轉(zhuǎn)錄組學(xué)，蛋白質(zhì)組學(xué)和磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)水平上建立了中國(guó)LUAD的完整圖譜。該蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)集作為一種寶貴和強(qiáng)大的資源，將加快基礎(chǔ)研究轉(zhuǎn)化為臨床實(shí)踐中更精準(zhǔn)的診斷和治療。
  
  參考：
  
  【1】https://medicalxpress.com/news/2020-07-scientists-reveal-comprehensive-proteomic-human.html
  
  【2】https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(20)30676-0#%20
  
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